Седалището и териториалният обхват на РЦЗ съвпадат с населеното място и границите на област Стара Загора. Центърът се ръководи и представлява от директор.  Директорът на РЦЗ е орган на изпълнителната власт към Министъра на здравеопазването за организиране и осъществяване на държавната здравна политика на територията на областта.

РЦЗ осъществява, налага и контролира провеждането на територията на областта държавната здравна политика, чрез своите информационни, консултативни и координационни функции. Центърът е регионален координатор и отговаря за координацията между МЗ и институциите и организациите на регионално ниво.

Провежданата от РЦЗ политика е насочена към:

• Промоция на здравето и профилактика на болестите, чрез  организиране и координиране изпълнението на регионално ниво на национални и регионални здравни програми
• Развитие на адекватна здравна мрежа, отговаряща на потребностите на населението на областта от здравни грижи.
• Ангажиране и сътрудничество на здравните власти с всички институции, местната власт и широката общественост за разрешаване на специфичните проблеми на здравеопазването в областта.
• Осигуряване на достъпна, своевременна, достатъчна и качествена здравна помощ, като основен приоритет в контролната дейност на РЦЗ е гарантиране правата на пациентите.